健康信息技术前沿加速项目 (LEAP) 获奖者MedStar 健康研究所与乔治城大学医学中心和HealthLab合作开发了两种新的数据工具,作为 MedStar 快速医疗互操作性资源® (FHIR) 工厂:一种不断发展的数字架构以扩大健康研究项目的一部分。项目团队开发了 FHIR 工厂,这是一种增强型数据平台(或数据工厂),使研究人员能够轻松访问标准化格式的数据并进行大规模提取和分析。这些数据工厂使用 FHIR 将数据转换为可通过应用程序编程接口 (API) 访问的可操作知识,并将这些可操作知识带到临床护理的第一线。
通过 ONC 的 GitHub 存储库(需要注册)提供的两个新数据工具包括 Bugs & Drugs FHIR Factory 和 Trend Engine FHIR Factory,它们是专门为利用标准化 Health Level Seven International ® (HL7) FHIR 数据而设计的,符合 ONC 治愈法案最终规则对认证健康 IT 的要求。
这些 FHIR 工厂的框架使用 FHIR API 自动、迭代地提取数据、转换和集成数据。FHIR 工厂的基础设施还提供端到端、闭环自动化。这些开源和开放标准工具促进了互操作性,并将 HL7 的 FHIR 标准引入数据工厂,并通过 FHIR 工厂平台创建了可互操作的数据提取和分析途径。由于利用了 FHIR,这些工具可以与任何 EHR 配合使用,而不仅限于单一供应商。
fhr工厂概览图。
图 1:FHIR Factory 概览,包括四个迭代步骤:(1)提取;(2)转换;(3)输出;(4)集成。在步骤 1 中,可以使用批量 FHIR 提取患者数据,批量 FHIR 通过 FHIR API 提取大量数据,而个人查询则一次提取一个人的数据。
带有 SMART-on-FHIR 应用程序的 Bug & Drugs FHIR Factory
Bugs & Drugs FHIR Factory 提供近乎实时、连续的抗生素图谱,用于确 电影电子邮件列表 定治疗泌尿道感染的首选药物。
抗生素图谱是某些微生物对抗菌药物的敏感程度的概况,培养和药敏结果时帮助确定给患者使用哪种抗生素。
与OpenEMR配合使用的 SMART 应用程序采用 FHIR Factory 创建的抗生素图谱并将其显示给提供商;结果表中包含功率计算和统计意义。随着新信息添加到 EHR,抗生素图谱将更新,这意味着它比传统的已发表研究更为最新。它还可以跟踪当地和地区的抗生素耐药性。修改基于Apache Airflow的 FHIR Factory 可以使该工具也用于为其他类别的感染创建抗生素图谱。
趋势引擎 FHIR 工厂
项目团队还开发了 Trend Engine FHIR Factory,以监测各种疾病、资源利用率、药物使用等方面可复制的趋势。趋势引擎可以利用 EHR 数据来监测发病率、医疗服务利用率、实验室检测和临床诊断(例如,COVID-19、流感、中风的诊断趋势)。项目团队专注于阿片类药物用例,使用 Trend Engine FHIR Factory 寻找阿片类药物使用导致的每日、每月和每年急诊室入院率的显著模式。趋势引擎已在其他 50 多种疾病条件下复制。各个社区的医院也可以使用此工具来跟踪干预措施的有效性。MedStar 设想,研究人员和医疗中心可以拥有一个包含不同交钥匙趋势引擎的工具箱,他们可以插入和部署这些引擎来跟踪各种类型的趋势。
FHIR 工厂的未来用途
由于 FHIR 工厂可以自动执行数据科学家的重复操作,因此其独特的输出之一是能够生成实时研究文章并轻松扩展医疗保健研究。每次刷新数据时都可以自动重写文章,从而创建近乎实时且几乎始终最新的结果。文章可以包括统计数据、模拟和可视化。FHIR 工厂还可以自动通过 API 调用提供文章中的每个结果,从而使文章在临床医生的工作流程中可用。
展望未来,MedStar 团队计划继续通过期刊文章和会议海报分享他们的学习成果,以便更广泛的医疗 IT 社区能够继续改进 FHIR Factory 架构。不要错过12 月的2023 ONC 年会,LEAP FHIR Factory 团队将在会上分享他们的工作成果